ニュース解説：米アップルのスパコンは「話半分」に
ちょっと変な記事。
ですが、G4で構築すると言ったらそいつの頭はおかしいです。G5ならまあいい線いってる。だからバージニア工科大のはいいのですが。
で、どれがいい？かというと並列性が高い計算だったら（独立性が高い）たぶんOpteron 4-wayをGbE Trunkでクラスタしたやつがいいでしょう。ガウシアン？低電圧版ItaniumのほうがG5よりはるかに速いと思いますよ。
分子探索かぁ。
で、管理コストですが、HPCでの管理コストはMacは決してやすくなかったはずです。チューニングに手間がかかるのはどのプラットフォームでも同じなので。
その点でいけばライブラリやら何やらの支援で導入期間などを考えればItaniumは結構高評価です。